本科自亞東紀念醫院創辦即開始作業，提供有關大腸、直腸及肛門疾病之門診診療手術及住院診療等服務。現有主任醫師一名、主治醫師四名、及專科護理師一名。



因人類直立的姿勢和肛門直腸的靜脈壓力所引起之痔瘡，為現今許多人有口難言之隱疾，直腸外科對於痔瘡、肛門廔管、肛裂、坐骨直腸窩膿瘍、結腸息肉、憩室、腸癌、腫瘤或大腸、直腸之外傷等，均能施予具專業手術以解決病患之痛苦。亞東紀念醫院大腸直腸外科將竭盡全力為病患服務，以期達成全民醫療之目標。