癌症是國人死因的頭號殺手，發生率與死亡率亦不斷上升。就臨床癌症治療而言，手術、放射線及化學治療仍是主流，本科於民國八十六年十月成立，創立宗旨在提供以病患為中心的最優質的放射治療服務。
剛開始先提供癌病門診、病房會診、癌病諮商及相關轉診服務，開科之科主任熊佩韋醫師曾赴美國癌症領域排名第一的德州大學安德森癌病中心進修，並於返國後採購當時新北市第一台數位式加速器，並於於九十年十一月一日正式治療病患，於九十一年二月一日開始「三度空間順形放射治療」，之後於民國九十一年八月一日我們領先國內許多醫學中心率先推出「強度調控放射治療」，分別獲得許多病患及家屬肯定，及多家媒體採訪。
亞東醫院不斷創新並於九十五年升格為醫學中心，為了提供癌患最佳服務品質，投下巨資台幣一億五千萬圓，採購最先進的「導航螺旋刀」抗癌設備，成為全台灣第三家、北台灣第一家採用導航螺旋刀的醫學中心，並於九十五十二月十二日啟用治療第一位患者。九十六年一月則啟用近接放射治療儀，並於九十七年八月再裝設第二部螺旋刀，成為亞洲第一家擁有「雙導航螺旋刀」的醫院，再加上多種高階貴重之放射物理品質校驗設備，這使得本科成為國內最現代化之全方位腫瘤放射治療中心。
我們不斷的研究創新，屢創國內外第一，本院癌病放射治療的創新成果不僅刺激了國內各醫院引進影像導航放射治療設備，更成為許多國內外醫學中心觀摩之標竿醫院。 醫療服務方面： 本科提供身體任何部位腫塊之診查、癌症篩檢、癌症第二意見諮詢、及身體各部位良性或惡性腫瘤之放射治療。
民國86年 本科成立
民國90年11月1日正式治療病患
民國91年2月1日開始「三度空間順形放射治療」
民國91年8月1日推出「強度調控放射治療」
民國95年引進最先進的「導航螺旋刀」(全台第三家，北台灣第一家)
民國95年12月12日啟用「導航螺旋刀」治療第一位患者
民國96年1月啟用「近接放射治療儀」
民國97年8月裝設第二部螺旋刀(亞洲第一家擁有「雙導航螺旋刀」的醫院)
民國97年協助新加坡國家癌症中心放射腫瘤科人員培訓
民國98年5月完成幼兒腦瘤治療
民國98年8月協助馬來西亞Prince Court醫學中心放射腫瘤科人員培訓
民國99年4月協助馬來西亞Subang Jaya Sime Darby醫學中心放射腫瘤科人員培訓
民國100年7月協助菲律賓Makati醫學中心放射腫瘤科人員培訓
民國100年7月協助中國上海復旦醫院放射腫瘤科人員培訓
民國101年6月完成「全球首創-全皮膚導航螺旋刀斷層治療」
民國103年12月 亞東紀念醫院「乳癌放射治療品質提升—創新模具製作降低嚴重皮膚炎發生率」榮獲醫策會品質改善 創意獎與潛力獎
民國104年8月引進「GE Discovery CT590 RT-電腦斷層模擬定位儀」
民國104年9月引進最新型 「Elekta - Versa HD™ 直線加速器」
民國104年9月年推出「4D呼吸欄柵放射治療」技術
民國104年9月引進「主動式呼吸調控技術（Active breathing coordinator, ABC）」
民國105年4月協助中國四川重慶醫院放射腫瘤科人員參訪訓練
民國105年~108年獲得生策會「SNQ國家品質標章醫療品質獎創意獎」
民國107年2月引進「日本AbChes呼吸調控系統」
民國110年 醫策會醫病共享決策臨床機構實證運動-醫病共享決策臨床運用組-優秀團隊獎
民國110年 「乳癌高端放療不傷心」榮獲 SNQ 國家品質標章（醫院特色醫療組）
民國110年 「放療智慧照護E起來」榮獲SNQ 國家品質標章 (醫療類醫院組醫療服務組)
民國111年 獲國家醫療品質獎- 智慧醫療類解決方案組
民國112年 榮獲「國家醫療品質獎」- 智慧醫療類智慧解決方案組（門急診服務領域），並獲智慧醫療Smart Care 2022標章
民國113年 亞東AI Lab、廣達合作放射治療AI智慧自動圈選系統
-取得美國FDA與台灣TFDA
-取得專利認證(2024-2040)
民國113年 「立體定位放射手術/高精準螺旋刀放射治療」榮獲 SNQ 國家品質標章（醫院-專科醫療組）