本科多年來重視標準作業程序，訂定多項品管指標，不斷提升醫療品質，於2019年12月獲得全國認證基金會(TAF)在嚴格考核後頒發ISO-15189醫學實驗室認證。本科分子病理實驗室亦通過兩次台灣病理學會認證。
目前本科編制上依工作內容分為組織切片組與細胞抹片組，主要負責各項組織病理及細胞病理診斷工作，以提供各科臨床醫師作為治療之依據或評估預後情形，目前科主任為蔡建誠醫師，全科成員包括6位專任主治醫師，2位兼任主治醫師，11位醫事檢驗師(含4位細胞醫檢師)，及3位行政人員。
本院組織病理科成立於1983年，歷任鍾明燈、何逸僊、楊彰師等主任，於2001年搬遷至北棟地下一樓現址，並於2005年更名為解剖病理科。自2015年起，隨著本科於原址擴建，增設分子病理實驗室，以符合精準醫療之世界趨勢。本科注重各級人員教學，是台灣病裡界重要的住院醫師訓練醫院之一。自2003年迄今，已有11名住院醫師在本科完成住院醫師訓練，並全數順利取得解剖病理專科醫師證書。