"擁有近400萬人口的新北市，無疑是國內第一大行政區；而首善之區『板橋』，亦擁有近60萬之人口，但偌大的行政區內，卻沒有一家醫院具備執行開心手術之能力！而遠東集團徐董事長本著其父徐有庠先生創辦亞東醫院之初衷，使得新北市心臟病患者無須遠赴台北市接受治療，特聘朱樹勳教授接掌亞東醫院。
朱樹勳院長於民國八十八年九月到任後便積極發展心臟血管醫學，從與台大醫院建教合作、人員的培訓、設備的採購與更新做起，四個月後成功地於八十九年元月十八日完成台北縣首例的開心手術，並於九十年元月十八日完成「三心人」之心臟移植。
隨著心臟血管外科的迅速發展，亞東紀念醫院已於八十九年十月申請通過為中華民國心臟學會暨中華民國胸腔及心臟血管外科學會認可之專科醫師訓練醫院，將投注更多的心力以培養更多心臟血管外科的人才；此外本院也在八十九年八月獲得衛生署醫政處的審核通過，准許執行心臟移植手術。
本院心臟內、外科已於八十九年七月一日結合成立為心臟血管醫學中心，期望來院就診的所有心血管病患們能在最短的住院天數下，接受心臟內科最詳盡的檢查及治療，如：心導管檢查、氣球擴張術、放置血管支架、安裝心臟節律器等，以早期確立診斷或治療，而進一步需接受外科手術者亦能儘速接受處置，如冠狀動脈繞道手術、瓣膜修補或置換、先天性心臟病之矯正、主動脈瘤切除、動靜脈.管、末稍血管手術等，藉此造福所有心臟疾患、末稍血管疾患暨國內眾多洗腎人口。
綜觀數千例手術中，微創開心手術亦本院積極發展之核心專長，不論二尖瓣、三尖瓣、或是主動脈瓣手術，本院目前都可以利用胸骨旁或右側開胸等不須鋸開胸骨的〝微創手術〞來完成，且高達八成的心臟瓣膜手術接用微創方式進行； 而以不停跳技術執行單純冠狀動脈繞道手術比例更是超過85﹪。微創主要是針對傷口的大小與位置做調整，透過傷口的減小，病人可以維持胸骨的完整性、減少手術後的疼痛、並降低肺功能的傷害。除了傷口大小的不同之外，根據我們過去的經驗，微創手術的住院時間、加護病房停留時間、術後死亡率、術後拔管時間等都比正中開胸方式來得短（小），而在我們少數重次微創手術看到結果發現造成的組織沾粘也比較少，可降低重次開刀時的風險。而數量最多冠狀動脈繞道手術，亦有相當比例可以不經過胸骨以左側開胸來完成。
為了確保手術品質，本院已引進手術室內血管攝影系統，能夠在完成冠狀繞道手術後即時以血管攝影來確認暢通性。在周邊動脈阻塞疾病方面，有了血管攝影的利器，可以在手術室內整合氣球擴張、支架置放等血管內治療的方式，或是外科手術，使更多患者免於截肢的命運。
九十九年引進最新達文西手術系統機型，並且成功的完成全內視鏡達文西冠狀動脈繞道手術、達文西二尖瓣修補手術等，本院目前已應用達文西手數系統進行冠狀動脈繞道手術、二尖瓣修補術、開放性動脈導管阻斷術及胸主動脈瘤人工血管置換術等相關全內視鏡微創手術，達文西手術系統，讓開心手術不再是大手術。
發展心臟血管醫學是亞東紀念醫院主要方針之一，延攬人才、投資設備，及教學研究等將持續的進行，以期成為台灣首屈一指的心臟血管醫學中心！"
1999 朱樹勳教授接任本院第五任院長,並成立心臟血管外科
2000-01 本院第一例開心手術
2000-03 以微創方式完成心臟不停跳動冠狀繞道手術
2000-07 成立為心臟血管醫學中心
2000-08 經衛生署核定為准予施行心臟摘取及移植手術之醫院
2000-10 通過中華民國心臟學會暨中華民國胸腔及心臟血管外科學會認可之專科醫師訓練醫院
2001-01 完成「三心人」心臟移植
2001-07 以內視鏡擷取大隱靜脈,完成冠狀動脈繞道手術
2001-08 已瀕死之心臟經人工心肺機輔助後,成功完成心臟移植手術
2002-11 成功完成「內視鏡輔助微創冠狀動脈繞道手術(MIDCAB)」
2003-02 心臟手術達一千例
2003-03 微創側胸小傷口完成心房中膈缺損修補手術
2004-11 通過衛生署『國家生技醫療品質獎』銅獎
2004-02 以內視鏡微創方式完成主動脈瓣膜置換手術
2004-04 以內視鏡微創方式完成二尖瓣辦膜修補手術
2004-10 以內視鏡微創方式完成二尖瓣辦膜置換手術
2005-02 心臟手術達兩千例
2006-07 升等為新北市醫學中心
2007-02 微創心臟手術達五百例
2007-08 心臟手術達三千例
2007-10 完成腹腔鏡腹主動脈瘤切除-人工血管置換術
2008-06 冠狀動脈繞道手術達兩千例
2010-06 心臟手術達四千例
2010-05 通過醫策會『冠狀動脈疾病照護品質認證』
2010-06 達文西機械手臂完成全內視鏡冠狀動脈繞道手術(TECAB)
2010-07 達文西機械手臂完成胸主動脈瘤置換手術(Robotic assisted TAA grafting)
2010-07 達文西機械手臂完成先天性動脈導管閉鎖不全(PDA)手術
2010-08 達文西機械手臂完成先天性心房中膈缺損(ASD)修補手術
2010-11 冠狀動脈繞道手術達兩千五百例
2011-03 微創心臟手術達一千例
2011-11 達文西機械手臂完成二尖瓣辦膜置換手術
2012-01 榮獲醫策會『SNQ國家品質標章』
2012-04 達文西機械手臂完成左心房粘液瘤(LA myxoma)切除手術
2013-07 心臟手術達五千例
2013-08 冠狀動脈繞道手術達三千例
2013-12 達文西機械手臂完成心室中膈缺損(VSD)及卵圓孔閉合不全(PFO)修補手術
2014-07 達文西機械手臂完成二尖瓣辦模置換術
2014-12 內視鏡微創手術完成一歲女童先天性心房中膈缺損
2015-01 微創心臟手術達一千五百例
2016-03 心臟手術達六千例
2016-04 為高齡99歲病患進行微創瓣膜修補手術
2016-06 達文西機械手臂完成先天性主動脈狹窄手術
2016-08 冠狀動脈繞道手術達三千五百例
2017-09 微創心臟手術達兩千例
2018-10 心臟手術達七千例
2018-11 榮獲生策會『國家新創獎-臨床新創』
2018-12 成立「 微創瓣膜中心 」
2019-02 冠狀動脈繞道手術達四千例
2019-11 生策會 「 國家新創獎-臨床新創 」 續獎通過
2019-11 邱冠明醫師個人榮獲 「 台灣醫療貢獻獎 」
2020-03 微創心臟手術達兩千五百例
2020-10 心臟手術達八千例
2020-11 生策會 「 國家新創獎-臨床新創 」 續獎通過
2020-11 邱冠明醫師個人榮獲 「防疫特殊貢獻獎」
2021-10 心臟手術達八千例